洁净厂房对空气的温度，湿度洁净度要求较高。设计者要根据工艺要求，生产洁净度级别合理选用建筑材料，考虑耐火性能，从而达到洁净厂房设计要求。
洁净厂房的低成本主要低在中央空调和分体空调的价格及相关配套的施工上。以30匹空调机为例，水冷柜机加冷水塔，加管道等总在11～15万左右，用分体空调15～20台，也就在2～3万元，同样可以达到单纯的温度要求，投资额要差一半。
承担洁净厂房工程的施工企业，应具有相应工程施工的资质及其等级，并应具有完善的质量管理体系。
洁净厂房的施工应按设计文件、合约的内容实施。当修改设计时，应经原设计单位的确认、签证，并得到建设单位的同意。
洁净厂房施工前应根据具体工程项目的特点，制订施工方案和程序，做到各工种协调施工、阶段明确、交接清楚，确保整体施工质量和安全操作。
洁净厂房装修工程基层状况的确认，应符合下列要求；
（1） 基层养护应达到设计要求；
（2） 基层表面平整度、垂直度及阴阳角方正；
（3） 基底应坚实、牢固，不得出现蜂窝、麻面、空鼓、粉化、裂缝等现象；
（4） 新建筑应将建筑物表面建筑残留物清理干净，并用砂纸打磨；旧墙面在施工前应将疏松部分清理干净，并涂界面剂后再补平；
（5） 当在混凝土或抹灰基层上施工时，含水率要求：溶剂型涂料时宜大于8%；水性涂料时宜大于10%；
（6） 抹灰基层施工应涂刷均匀、粘结牢固，不得漏涂、起皮、起泡、流坠和裂缝等。
洁净厂房中排风管道的制作，应符合下列规定：
（1） 可燃、有毒的排风风管的密封垫料、固定材料应采用不燃材料；
（2） 风管所用螺栓、螺母、垫圈和铆钉均应采用与管材性能相适应，并不产生电化学腐蚀的材料；
（3） 镀锌钢板不得有镀锌层严重损坏的现象，如表层大面积白花、镀层粉化等；
（4） 风管法兰的螺栓及铆钉孔的间距，不应大于100mm；矩形风管法兰的四角部位应设有螺孔。
